Curso de Extensão
"Ferramentas de Bioinformática no Desenvolvimento de Vacinas"
(19 a 23 Janeiro de 2009)

Módulo I:
- Montagem da resposta imune;
- Bancos de Dados (NCBI, PDB, ICTVdb);

Módulo II:
- Reatividade cruzada e autoimunidade;
- Teoria e aplicação do Blastp (Basic Local Alignment Search Tool for proteins) e
- HHpred - Homology detection & structure prediction by HMM-HMM comparison- Modelagem de proteínas (por homologia), através do Software Geno 3D e Modeller;

Módulo III:
- Visualização de Proteínas (Swiss-PDBviewer);
- Ferramentas de Predição de Epitopos (EpiJen v 1.0 e DiscoTope 1.1);

Módulo IV:
- Simulação de proteolise (NetChop 3.0 e PAProC I) ;
- Capacidade de ligação à proteína transportadora de antígenos (TAP) dos epitopos escolhidos (AntiJen e TAPPred);

Módulo V:
- Desenvolvimento de Vacinas.
- Discussão sobre os epitopos selecionados pelos alunos e sua capacidade de serem utilizados como potenciais alvos virais em vacinas.